بعد الحرب العالمية الثانية ، طورت منظمة قادة التحالف في اليابان وكالة جديدة للمساعدة في إدارة حوادث الإرهاب والعنف داخل منطقة المحيط الهادئ. كانت الوكالة مزودة بأفراد من النينجا وكُلفوا في البداية بمعالجة الشؤون الداخلية. ولكن لاحقاً تطور هذا البرنامج إلى شكله الحالي، حيث يتم إدارة حوالي 20.000 عضو من النينجا من قِبل مجموعة مدراء من الشؤون الداخلية والدولية. أحد هؤلاء النينجا هو كودو. يستعد الآن الفتى الفاشل في المدرسة الثانوية البالغ من العمر17 عامًا ليكون الحامي في خط الدفاع التالي ضد الزيادة المحتملة في عدد القتلة الأجانب الذين يغزون طوكيو.